Des concentrations de matériel lithique (Pierres taillées et polies), sur les contreforts de la forêt d’Othe, révèlent de nombreux sites d’occupation néolithique. En fond de vallée, les sépultures et l’enceinte à fossé interrompu de Champlay, fouillées par André Merlange, complètent la documentation pour cette période.

Le nom même de notre ville dans les textes les plus anciens, Joviniacum, les toponymes (Joigny-la-Ville = Joviniacum villa), fanums, thermes et ferriers de Haut-le-Pied, donnent à penser que l’implantation humaine durant l’époque romaine fut tout aussi dense.

La découverte de sarcophages de pierre place de la République et autour de l’église Saint-Jean montrent la continuité de cette occupation durant l’époque mérovingienne.

L’histoire écrite de Joigny ne commence réellement qu’à la fin du Xe siècle avec la construction d’une place forte par Raynard le Petit Vieux, comte de Sens, à Joigny sur l’emplacement d’un prieuré en même temps que le château de Château-Renard. C’est alors que l’actuelle ville va naître sur les pentes d’accès à la forteresse.

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