Les comtes de cette famille furent enterrés comme la comtesse Jeanne dans la chapelle de l’hôpital.
Notons que Miles II, prisonnier après la bataille d’Auray, voit sa rançon payée par les Joviniens.
Jean IV, son fils, est l’une des victimes du Bal des Ardents le 31 janvier 1393.
Louis, confirmé 1er des Pairs de Champagne, n’eut qu’une fille qui épousa Guy de la Trémoille. Ce dernier était partisan des Armagnacs ; les Joviniens, qui n’étaient pas d’accord avec lui, prirent d’assaut le château, armés de maillets; ce qui leur valut le surnom de Maillotins.

Par les filles, le comté passe aux familles Chalons, puis Sainte-Maure.
En 1530, la ville est ravagée par un terrible incendie. Louis de Sainte-Maure, qui devient peu après titulaire du comté, donne totale liberté aux habitants de couper du bois dans ses forêts pour reconstruire leurs habitations. Il entreprend lui-même la reconstruction du château dans le style nouveau, Renaissance. Il sera l’un des otages envoyés en Angleterre après le traité de Cateau-Cambrésis.

Le comté passe, en 1576, aux Laval, dont le dernier, Guy, épouse Marguerite Hureau qui continue la reconstruction du château commencée par Louis de Sainte-Maure. Les héritiers de Guy de Laval vendent le comté et le château au cardinal Pierre de Gondi, évêque de Paris, le 15 décembre 1603.
Durant les 30 dernières années du XVI e siècle, Joigny eut beaucoup à souffrir des Guerres de Religion, durant lesquelles le parti pris par le comte et les Joviniens n’était pas toujours concordant. L’hôpital Neuf-lez-Pont, qui avait été reconstruit sous ce nouveau vocable, sera de nouveau brûlé. La grande église-hôpital ne sera jamais reconstruite.

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